張谘（朝廷於公元189年任命，被孫堅以不提供軍糧為由殺害於公元190年）
袁術（劉表為了示好於袁術，表其為南陽太守，公元193年袁術迫於壓力棄守南陽，轉向揚州發展）
張繡（於公元197年左右占據宛城）
長沙太守：孫堅（孫堅於190年平定區星的叛亂後，朝廷任命其為太守）
蘇代（吳人蘇代在孫堅攻打董卓時自領長沙太守）
張羨（劉表攻殺蘇代，任命其為長沙太守。後叛表，劉表圍之連年不下，病逝）
張懌（張羨之子，張羨死後，被眾人立為長沙太守，後被劉表攻殺）
韓玄（張懌被殺後，劉表任命其接任）
司隸校尉
河內太守：朱儁（朝廷於公元185年任命，討伐張飛燕）
李敏
王匡（朝廷於公元189年任命，於公元191年被曹操殺害）
張楊（朝廷於公元191年任命。公元198年，河內的張楊在曹操進攻呂布時，出兵聲援呂布，不久張楊被部將楊醜所殺）
眭固（不久，眭固又殺了楊醜，占據河內，投靠袁紹。公元199年，曹操派史渙攻占射犬，殺了眭固，控製了河內郡）
河南尹： 朱儁（由於討伐黃巾軍作戰有功，朝廷任命其為河南尹。公元190年二月，董卓劫帝西遷，留朱儁守洛陽，朱儁便和山東諸將通謀欲做內應，後來害怕董卓襲擊自己，於是棄官逃往荊州）
楊懿（朱儁逃走後，董卓任命。朱儁聞訊率兵還洛陽，楊懿退走）
注：朱儁趕走楊懿後，見河南殘破，無所依憑，於是向東屯駐中牟。董卓死後，李傕、郭汜殺死王允，占據長安，召朱儁入京為太仆。當時，陶謙等人建議朱儁發兵攻打李郭，輔助幼主，但朱儁沒有聽從，奉召進京，失去了重興漢室的一個良機。公元195年，李傕、郭汜劫持天子，相互攻擊，朱儁見此憂懣而死。
益州刺史：劉雋
郤儉（公元188年6月被殺，涼州逆賊馬相、趙祗等於綿竹縣自號黃巾，合聚疲疫之民得數千人，先殺綿竹令李升，吏民悉集，便前破雒縣，殺死郤儉。又到蜀郡、犍為，相自稱天子，眾以萬數，州從事賈龍在犍為東界擊破之，選吏卒迎焉。）
劉焉（朝廷於公元188年任命，於公元194年病逝）
劉璋（於公元194年繼任益州刺史）
注：其間朝廷曾經任命扈瑁、牛亶為益州刺史，皆未成。
（焉死，子璋代為刺史。會長安拜潁川扈瑁為刺史，入漢中。荊州別駕劉闔，璋將沈彌、婁發、甘寧反，擊璋不勝，走入荊州。璋使趙韙進攻荊州。）
（趙韙因民怨謀叛，乃厚賂荊州請和，陰結州中大姓，與俱起兵，還擊璋。蜀郡、廣漢、犍為皆應韙。璋馳入成都城守，東州人畏，鹹同心並力助璋，皆殊死戰，遂破反者，進攻韙於江州。韙將龐樂、李異反殺韙軍，斬韙。漢朝聞益州亂，遣五官中郎將牛亶為益州刺史；徵璋為卿，不至。）
漢中太守：張魯（劉焉派遣張魯與張脩將兵擊漢中太守蘇固，張魯襲殺張脩並其眾，攻占漢中。公元194年，劉焉病逝，劉璋繼位，以張魯不順從殺害其母親以及家室，由此張魯與劉璋決裂）
交州刺史：朱符（為夷賊所殺）
張津（朱符死後，漢遣張津代之，後為其將區景所殺）
賴恭
注：劉表意圖染指交州，賴恭被其派遣代替被手下區景殺害的交州刺史張津，與同期到任的吳巨不和，被吳巨舉兵逼回故鄉零陵，後投靠劉備。後孫權使步騭平定交州，吳巨為步騭所殺。
交趾太守：士燮（子士祗、士徽）
合浦太守：士壹（子士匡）
注：孫權於士燮死後，以交阯縣遠，乃分合浦以北為廣州，呂岱為刺史；交阯以南為交州，戴良為刺史，又遣陳時代燮為交阯太守。士徽自署為交趾太守，閉城以據孫權，呂岱發兵討之，士祗、士匡等人縛士徽請降，呂岱殺士徽，赦免了其他人。
南海太守：士武
九州太守：黃有
蒼梧太守：史璜
吳巨（史璜死後，劉表任命其為蒼梧太守）
涼州刺史：耿鄙（於公元188年被殺）
韋康（曹操任命）
西涼太守：韓遂 馬騰
徐州刺史：巴祗
陶謙（朝廷於公元188年任命，病逝於公元194年）
劉備（陶謙公元194年讓徐州刺史於劉備，於公元196年被呂布奪取）
呂布（於公元196年擊敗劉備，奪占徐州。後曹操於公元198年滅掉呂布，占據徐州）
車胄（曹操於公元188年任命，於公元199年被關羽斬殺，劉備重據徐州）
劉備（於公元199年斬殺車胄奪占徐州，曹操於200年擊潰劉備，奪回徐州，此後徐州一直被曹操占據）
廣陵太守：張超（朝廷公元189年任命，於190年左右離職，後於195年在雍丘被曹操殺害）
趙昱（陶謙於公元190年左右任命，後於公元194年被笮融殺害）
陳登（曹操任命）