三、如何調整內部財務管理
農業科研單位的財務管理曆來是經濟管理的重要方麵。農業科研單位的財務規範化管理的基本涵義是按照國家統一政策法令和規章製度，執行根據本單位的實際情況製定的具有眼科規範意義的做法判別的標準是要保證農業科研單位進行活動所需資金的有效供給和資金的高效利用。在具體操作上，農業科研單位的財務管理辦法要體現“嚴、活、靈”，“嚴”即對國家撥給的有限的事業費要嚴格控製開支、節約經費，可以實行研究所和職能部門分塊下撥，院、所兩級管理，核定基數自求平衡。“活”即對科研經費的掌握使用切實執行課題核算製，但在審批權限和使用範圍上，應從利於科研活動正常進行的角度出發，給課題組較大的自主權，微觀上要放活。“靈”即對不同類型的項目采取各種靈活的辦法，如人員事業費實行“包幹製”；研究經費實行“基金製”；開發經費實行“有償製”；經營實體實行“借貸製”；大院大所可引進銀行機製，建立內部銀行，在院、所內部實行資金融通拆借，充分發揮資金效益。
根據目前科研和市場密不可分的新特點，我們應在以下幾的方麵加以重視。
（1）農業科技開發投入不足
農業科技成果本身的特點是周期長，開發難度大，經濟效益低，投機風險性大。而國家的資源配置偏向能源、交通、通訊和大工業，口頭農業依然存在，國家對農業資金投入長期不足，而科技開發收入又少，除去補充事業費不足，支付稅金、酬金以外所剩無幾。不少農業科研單位又不敢貸款或貸不到款，就是能貸到款的單位又難以承擔銀行貸款高利率的風險。由於資金不足，從而對科技開發規模、增效益及擴大發展帶來一定的限製。
（2）經濟實體少且規模小
因為農業科技開發投入不足，加上經濟實體多生產的技術商品化產品的市場營銷多數是在技術服務的地域範圍或關係圈內，還沒有形成社會性市場，農業科技開發的擴展市場手段上無力應用，再由於農業業科技成果本身存在著公益性強，技術可控性差的特點，其應用的主要對象是農民，生產經營分散，但願規模不大。
（3）現有技術成果開發程度低，開發後勁不足
現有的農業技術成果多以種子、種苗，單一產品或技術為主，技術成果與市場脫節，造成農業技術成果可開發性差，加之科學研究與生產（市場）脫節的局麵還未完全改變，科研滯後於市場，是農業科技開發後勁不足，對未來開發產品，特別是開發高新技術產品，競爭性產品等許多研究所感到力不從心，困難重重。
（4）經營管理水平差
農業科研事業單位逐步向市場經濟過度的過程中，如何進行管理，缺乏模式和經驗，過去科研單位重技術不經營，出成果不搞有償轉讓，造就了一批隻會搞科研，不善搞開發。隻會傳播技術，不善經營技術，不善於麵向市場，缺乏創新開拓，特別是缺乏具有商品觀念和經濟頭腦的攻關推銷人才，使科研單位組織收入的局麵很難打開，也形成不了規模，從而在科技開發中，對項目選擇、人才安排、產品設計、質量、規模、成果、資金運用、組織管理、市場營銷擴展，效益等因素難以綜合運籌。