實驗2：孔雀魚是生長在南美洲的一種淡水魚，公魚身上有亮麗的花斑，其作用是吸引母魚的注意，以利於傳宗接代。孔雀魚還有一種本事，就是把自己偽裝成溪流底部的碎石以逃避天敵（例如派克鯛）的攻擊。這就產生了一個矛盾：花斑越亮麗就越容易吸引母魚，也就越利於傳宗接代；但同時就越難偽裝成碎石，因而就越容易被天敵吃掉。從理論上講，在這兩種因素的夾擊下，進化的結果應使公孔雀魚身上的花斑達到某種平衡。恩德勒（john endler）博士設計了一個實驗來對此進行驗證。他在10個大水池裏養上同樣數量來自同一處的孔雀魚，其中5個水池的底部鋪細礫石，另5個鋪粗礫石。恩德勒在兩個細礫石水池和兩個粗礫石水池裏放入對孔雀魚威脅很大的派克鯛，在另外兩個細礫石水池和兩個粗礫石水池裏放入威脅較小的鏘魚，剩下的兩個水池裏隻有孔雀魚。孔雀魚在這些不同環境中進行繁衍，恩德勒在第五個月和第十四個月時各進行了一次檢測，結果是令人震驚的。5個月時的檢測顯示，在那4個有派克鯛的水池裏，孔雀魚身上的花斑明顯變少、變暗。而另外6個水池裏的孔雀魚身上的花斑則明顯變多，也變得更亮麗。到第14個月時，這種變化更加明顯。除此之外，還有一個更有意思的現象，在兩個有派克鯛且鋪粗礫石的水池裏，孔雀魚身上的花斑不但變少、變暗，而且變大！相反，在兩個有派克鯛且鋪細礫石的水池裏，孔雀魚身上的花斑顯著變小。這種變化顯然是為了使其能更易混跡於池底的礫石之中以躲避派克鯛。這個實驗同時還告訴我們，在自然選擇下的進化過程有時可以是很快的，甚至在幾代之後就能顯現出來。
按照進化論，生物在自然選擇下進化的“動力”主要來自兩個方麵：有效生存（占有資源、逃避天敵等等）和繁衍後代。當然前者是更優先的，如果無法生存，就談不上繁衍。孔雀魚的實驗非常清楚地印證了這一點。
對進化論的威脅不僅來自創世論者花樣百出的質疑，同時也來自一些極端的進化論者。尤其是有些人將進化論毫無節製地外推到社會學領域，從而導致反人性的種族理論。一個最典型的例子就是希特勒在納粹德國推行的種族淨化運動。如果這種運動隻是一些狂人毫無科學根據的胡思亂想，也許還不至有太大的市場。令人擔憂的是，從純科學的角度看，用人工選擇的辦法通過進化而產生出“超人類”的可能性起碼在理論上並非完全不可能。
在用計算機對人類和黑猩猩的dna序列進行對比分析後，人們發現變化最大的是基因組中一段含有118個基因碼的基因——1號人類加速區（har1），有18處不同。而對比雞和黑猩猩的dna，同樣這段基因隻有兩處不同。可以想象，如果用某些方法使一批人的har1發生變異，“進化”出來的變種也許就是一批“超人類”。由此引起的社會問題將是極為嚴重的，後果很難預估。這類問題也是一些創世論者用來攻擊進化論的一大理由，他們宣稱進化論會引起種族歧視、破壞社會和諧。遺憾的是他們犯了一個巨大的錯誤——把極端的泛進化論與科學的進化論混為一談了。