武田信廣死後，蠣崎氏的家督之位由其嫡子蠣崎光廣繼承，並繼任上國守護職。而鬆前守護下國定季也在這個時候死了，其子下國恒季繼承了家督之位。
不過下國恒季生性殘暴，肆意誅殺家臣，因此不少下國氏的家臣便暗中向蝦夷名義上的支配者安東氏密報。安東氏對此情況很是重視，派人捕殺下國恒季。最終在明應五年（公元1496年），下國恒季礙於壓力被迫自殺，鬆前副守護相原季胤（鬆前副守護相原政胤之子，相原政胤之前便死在了阿依努人暴動中）升任守護，村上政儀出任副守護。
原本，按照這樣的情況發展下去，蠣崎家想要製霸蝦夷地區無疑是相當漫長的，不過，讓蠣崎家極為憎恨的阿伊努族人卻在這個時候又幫了蠣崎家的忙！
永正九年（公元151），蝦夷東部地區的阿依努人再次發生暴動，箱館、誌濃裏、與倉前三館陷落。箱館館主河野季通（河野政通之子）、誌濃裏館主林良定、與倉前館主林季景切腹。
次年的永正十年六月，阿依努人又突然襲擊了鬆前大館，守護相原季胤、副守護村上政儀自殺，鬆前守護相原家滅亡。
至此，之前的下國守護安藤氏早已沒落，鬆前守護下國氏和相原氏相繼滅亡，整個蝦夷地區就僅剩蠣崎家這一個“三守護”了。
隨著“三守護”體製的滅失，雖然蠣崎氏已經成為了蝦夷地區名義上的統率者，但是蠣崎家依然是檜山安東家的從屬。蠣崎家的一切行動，也必須首先得到檜山安東家的肯定。
蠣崎光廣雖然覬覦蝦夷的支配權，多次派遣使者前往檜山安東家那裏請示，但是使者往來一次需要數月，而且檜山安東家不知道為什麼就是不對蠣崎氏成為蝦夷支配者一事鬆口。
後來，檜山安東家當主亡故，下一任當主便是安東舜季之父安東尋季了。安東尋季一來感念蠣崎家在蝦夷地區幫助安東家對抗阿依努族人有功，二來當時蠣崎家少主蠣崎義廣派遣一名叫做紺廣良的浪人為使再次前往安東家，獻上了蠣崎家在鬆前地區征收的來往商船以及行人的通行稅，安東舜季便將蝦夷守護的“判形”賜予了蠣崎家。
自此，蠣崎家終於如願以償的成為了蝦夷地區名義上的首領，但是卻依然無法擺脫檜山安東家的掣肘。畢竟，此時的檜山安東家對於蝦夷的影響力還是巨大的，而且檜山安東家的實力也不是才剛剛崛起的蠣崎家可以比擬的。未來的路還很漫長，蠣崎家也隻能默默的積蓄實力。
但是此時，讓蠣崎家又愛又恨的阿伊努族人又跳出來了。
不過，此時奠定了蠣崎家基業，有蠣崎家奠基第二人之稱（瑪德，蠣崎家之前總共才倆個當主，不明覺厲！）的蠣崎光廣，不願意在放任這些土著不管不顧了。於是在此之後，蝦夷地區純潔的土著阿伊努族人們，便逐漸被蠣崎光廣和蠣崎義廣這倆個資深老司機給玩壞了！