綱手告知時雨，要想真正的掌握濕骨林的仙術，首先的一點就是必須要掌握木遁，但是自從初代火影逝世以後，已經沒有人能夠真正的掌握木遁了，所以，相應的，濕骨林的仙術也就此失傳了。
但是時雨並不灰心，因為他並需要完整的濕骨林仙術，他需要的是要把三種仙術整合成自己的仙術。
就像宇智波斑一樣，隻要能夠得到濕骨林的仙術查克拉就行。
接著，時雨先跟綱手學習了百豪之術，自我改進後，用以儲存仙術查克拉，克服了仙術發動困難的弊端。
然後，他奉綱手之命，去追擊佐助。
麵對君麻呂的時候，他動用了貯備的仙術查克拉，發動妙木山仙術，毫無懸念的戰勝了他。
為了大蛇丸，君麻呂甘心赴死。
之後，時雨在終結穀追上了佐助，此時鳴人已經倒下了。麵對時雨，佐助自知難以敵對，他立刻再次進入了咒印二的狀態。
為了讓佐助見識到真正的咒印的用途，時雨解開了蛤蟆仙術，發動了地龍洞的仙術。
頭生雙角的時雨，輕易的戰勝了佐助，此時卡卡西也到來了。
不過，時雨放任佐助逃離，並沒有把他帶回木葉的想法，同時，他也阻止了卡卡西。
然後幾人便回到了木葉。
回到木葉之後的鳴人，執著於佐助的離開，跟時雨的關係出現裂痕，然後，自來也便帶著鳴人外出修行。
這就是原著中知名三年時間。
而時雨同樣也有自知之明，以他目前的實力，查克拉豐沛，身兼兩種仙術，同時封印術大成，飛雷神初虧門徑，雷切和螺旋丸開發到了極致，加上自己的體術和速度，繼承自三代火影的五屬性強力忍術及禁術，麵對現在忍界中的常規忍者，哪怕是影級強者，也不會是他的對手，但是麵對三年之後的強者，他的實力還差太遠。
曉還在其次，時雨的實力距離宇智波斑、初代火影這類的強者還相差很遠。
於是，他決定這三年的時間閉關修行，目的地就是濕骨林。
他不可能放棄第三種仙術，於是，透露了部分消息，掙得了綱手同意和允許之後，他得以進入濕骨林。
在濕骨林，時雨開始學習濕骨林仙術，但是濕骨林的仙術直接跟木遁相關聯，時雨並不會木遁，修行起來可謂是毫無進展。
最後，他以自己的水遁和土遁，模擬起“偽木遁”，才得以修行濕骨林仙術，但是威力上僅僅隻有初代仙術的三分之一。
這個時候，時間已經過去了半年，接下來的半年，時雨開始研究和開發飛雷神，然後，他有用了一年的時間，來整合自己所學的三種仙術，並且形成了自己獨特的仙術，威力遠超原本的三種仙術，最後的一年，他開始整理、鞏固自己的修行成果，將修行的內容完全的轉化成了戰鬥力。
等到時雨再次在木葉登場的時候，正好是佩恩襲擊木葉。
他出現的瞬間，便以飛雷神救下卡卡西，速度甚於“金色閃光”。
天道的神羅天征、萬象天引、地爆天星威力無比巨大，但是忍術與忍術中間的5秒間隙，對於時雨這樣的徹底掌握飛雷神，並且把它開發到了史無前例的深度的忍者來說，敵人僅僅的五秒漏洞，就等於直接把命門暴露了出來。
因此，解決佩恩毫無壓力，甚至連仙術都不用動用。
接著，他找到了長門，他並沒有鳴人那樣的嘴上功夫，因此便選擇殺死了長門，但是等他想要毀掉輪回眼的時候，阿飛出現了，並且取走了輪回眼。
這其中，有時雨刻意的意味，因為他苦練三年，就是為了對付宇智波斑，所以，還是讓斑拿回自己的輪回眼的好。
沒有輪回轉生，木葉實力大損，綱手在時雨的陪同下，參加五影大會。
大會上，其他四國以為木葉的實力大不如從前，便開始輕視，結果時雨一身力壓四影，為綱手爭取到了聯軍統帥的位置。
這個期間，佐助突襲木葉，殺死團藏。
大會中，宇智波帶土突然出現，宣布了“月之眼”計劃，自此，第四次忍界大戰開始。
時雨自身實力超過其他人太多，並沒有參與到常規部隊之中，而是作為機動力量，以飛雷神隨時支援戰場。