琴音的兒子三皇子賀觀是在狩獵的時候墜馬而亡的，那日賀觀的屍體被送回皇宮，琴音便去找了秦羽鳳，她臉上無悲無喜隻說了一句話：“皇兒本就為了娘娘而生，娘娘不需要，死便死了吧。”後來琴音也病死了。
天平三十七年賀鈺便病下了，自秦羽鳳從邊回來他便沒有再立妃，最終病床前不過守了四個皇子，分別是大皇子四皇子五皇子六皇子。但是若論能力，卻也隻有大皇子賀戚是可用之才。而且自北胡被收複，胡人和夏人相處融洽倒也不分血統，這個時候賀鈺動心立賀戚為太子，秦羽鳳沒有立場反對。
秦羽鳳和賀戚的確算得上八字不合，或許是因為他自己生母已經離世，克母倒是真的完全克到了秦羽鳳身上。那年她剛剛回宮幾個月，一次賀戚來椒房殿請安後，秦羽鳳寢殿的山水屏風無緣無故便倒了，後來她和菱兒在禦花園放風箏，賀戚到了之後，一陣大風便把風箏線吹斷，而且沒有結束，秦羽鳳想要去休息，路上無緣無故又起大風將一個蜂窩吹下來掉在她麵前，盡管她並沒有被傷到，卻真的記下來了賀戚真的和自己不和。
賀鈺病倒前便把一些權力移交給賀戚了，賀戚兩次輔助賑災，結交大臣也並沒有被賀鈺阻攔，如今也混得如魚得水。或許都覺得大皇子繼位是板上釘釘的事情，禮部和刑部對他格外順從。
秦羽鳳沒有把賀戚放在心上，但是她卻也有事情要發愁，八年前賀衡遭受暗殺在王府離世，然後賀威也失蹤了。這些年秦羽鳳一直在尋找賀威，卻始終沒有絲毫音訊，她甚至懷疑是賀鈺動了殺念殺了賀衡還有，他們的兒子。隻是她沒有證據，便心存希望。
病了大半年賀鈺突然有幾日清明，身子好了許多還拉著她在禦花園賞了兩日風景，看了一夜的月亮，真的是回光返照了。那夜賞完月賀鈺便又病倒了，秦羽鳳不在的時候他終於冊立了太子並且留下遺詔，這些都是後來墨侍告訴秦羽鳳的。秦羽鳳出宮了，再回來的時候是三日之後渾身都是血，當然她沒有穿著一身血衣去病床前。
最後那日賀鈺握著她的手說了很多話，問她願不願意和他合葬，當然其實也容不得秦羽鳳不願意，他已經在遺詔裏說明了合葬之事，隻是他以為秦羽鳳不知道罷了。這麼多年了，其實秦羽鳳和他鬥了大半輩子，兩個人都明白彼此在心裏什麼地位，這二十多年兩個人更像是朋友。
賀鈺的確是舍不得秦羽鳳的，也不想她被欺負，然而他必須把江山傳給賀氏子孫而不是一個女人。賀鈺最後還是告訴了她，他遺詔裏麵傳位賀戚，然後囑咐她好好輔佐賀戚，賀戚必定給她一世尊榮。但是秦羽鳳沒有告訴賀鈺的是，賀戚早在三天前便已經死了，她親手攔住他回來的路上，殺了他和他的侍衛三十餘人。
皇帝駕崩，墨侍將遺詔拿出來宣讀，最終定下尚未回來的大皇子為帝。次日大皇子遇刺身亡的消息傳來，秦羽鳳作為太後主持大局，垂簾聽政。然而國不可一日無君，很多人建議四皇子五皇子六皇子中的一位登基，秦羽鳳一力壓下去。終於在賀鈺死後將賀威的事情說了出來，流落民間的七皇子賀威，乾元皇帝唯一的嫡子。
雖然賀鈺的寢陵已經修建了二十年早就修建完畢，還是在二十一天之後正式下葬，皇陵留了活口，用於百年之後秦羽鳳安臥。
垂簾聽政第二年倭寇送來想要和大夏結百年之好的協議，願意永遠附屬大夏，秦羽鳳聽聞倭寇國一場地震過去子民死傷慘重，此番是為了尋求救治。同意下來，派送兵糧過去，倭寇便真的成了大夏的附庸國一百年，直到大夏亡國才罷。
期間有一個三十多歲的男子找到了皇宮裏，秦羽鳳單獨接見了男子，安葬了他送來的兩盒骨灰送到了當初為朱芷怡修建的陵墓。見過男子之後秦羽鳳治好了失眠之症，菱兒為此開心許久。
三年後賀威被尋找到了，他已經成了親帶來一雙兒女，妻子雖然隻是鄉野婦人卻文靜知禮，賀威沒有另娶的意思，秦羽鳳放心退位，由著賀威去過自己的生活。
退下來之後秦羽鳳便成日裏睡在椒房殿，因為已經沒有什麼掛念便開始嗜睡，菱兒放心不過，後來秦漢的妻子生了個女兒秦羽鳳便安心養著，身子也好了許多。
五年後，菱兒病重，賀威守在床前對於這個母後身邊的嬤嬤很是尊敬，自然要以兒子的身份侍疾。菱兒將秦羽鳳的一生講述給賀威聽後，賀威痛哭一場，當夜去了皇陵跪在自己父皇母後的寢陵前跪了整整三日。
賀威回來的時候對秦羽鳳是冷淡的，菱兒一直知道卻無從勸說，秦羽鳳也不主動緩和母子之間的關係，秦羽鳳已經病逝了，菱兒便也在最後的時候說出來真相，解開母子心結，雖然已經沒有什麼用了。菱兒病逝賀威還在皇陵不知道消息，最後將菱兒以皇後禮儀安葬，大孝之舉一時也成為佳話。