4.2微生態製劑調節腸道紊亂的作用機理 一方麵補充腸道的正常菌群或促進有益菌的增殖。另一方麵有益菌群對病原菌有明顯的生物拮抗作用：（1）產生化學物質，益生菌產生過氧化氫、有機酸、殺細菌素和抗生素等，不利於需氧菌及外來致病菌的生長、定植，如給雞喂乳酸杆菌後可明顯減少盲腸沙門氏菌的定居。另外，酸性環境刺激胃腸道蠕動，對素、病菌起到機械性排出的作用。（2）占位性保護，厭氧菌與黏膜上皮結合緊密，形成生物膜，封閉致病菌的侵入門戶，使外來菌沒有吸附位置而被排出。（3）爭奪營養，各種菌的營養分配是受環境限製的，以維持數量和種類上的平衡。如腸道中的厭氧菌特別多，而大腸杆菌較少，就是因為低PH環境下，厭氧菌能奪得較多的營養，致病菌得不到營養而一般不在腸內生長。此外，還可提高機體適應外界環境的能力，Zulkifli研究發現，雞喂乳酸菌培養物後（1g/kg），連續21天（3h/天）處於36℃的熱應激下，與不喂乳酸菌的雞比較有較高的飼料利用率並對NDV產生較高的抗體。
4.3微生態製劑與其他藥物的協同作用 （1）益生苗與寡糖的協同作用：寡糖作為某些益生菌的增殖因子，增強益生菌的競爭優勢；益生菌分泌的消化酶可使寡糖消化為單糖，被益生菌或機體利用。由於許多病原微生物的表麵有外源凝集素，能與腸上皮寡糖受體特異性結合，使細菌粘附在腸壁上並增殖，導致腸道疾病發生，而一些寡糖的結構與腸上皮寡糖受體相似，可與病原菌的外源凝集素特異性結合，使-病原菌不能在腸壁上粘附，而隨寡糖排出體外。（2）微生態製劑與抗生素的協同作用，對於腸道正常菌群紊亂嚴重或致病菌的危害比較嚴重時，可以先用抗生素清理腸道，然後用微生態製劑調理胃腸道。（3）益生菌與特異性疫苗的協同作用，益生菌刺激動物的免疫機能，當接受特異性的疫苗免疫、抗原刺激時，可促進動物產生高水平的特異性抗體，從而提高動物的抗病力。
5微生態製劑應用今注意的問題
5.1使用時間，動物的生長時期不同腸道正常菌群不同，對新生動物使用微生態製劑，效果較明顯，因為新生動物，正常菌群還處於連續變化的階段，更易受到微生態製劑的影響。一種微生態製劑是否有效，與由道該菌群的存在與否有關。
5.2種屬特異性，細菌對腸道的粘附具有種屬特異性，從某種動物分離的細菌隻對該動物消化道上皮有較強的吸附性，如豬用的微生態製劑用於其他動物不能發揮最大的療效。
5.3使用劑量，微生態製劑的使用量要適當，一般在3億個活菌左右。過量會導致腹瀉，過少則起不到治療的效果。
5.4保護活力，微生態製劑是活的微生物，不要與抗生素同時使用，若必須用抗生素清理腸道則要有一定的間隔時間。微生態製劑的活性很重要，但保存中的活菌率很不穩定，使用時注意產品的貯存條件和生產日期，最好用前檢測一下活菌數。