大衛年間，發生了兩次大災變，一次是饑荒，一次是瘟疫。饑荒一連持續了三年，大衛求問耶和華，耶和華說：“這饑荒乃是因為掃羅當年殺死了基甸人，報應到以色列人頭上的。”原來這基甸人不是屬於以色列，乃是亞摩利人所剩餘的。以色列人曾向他們發誓，不殺滅他們，掃羅卻為以色列人大發熱心，將他們殺死了很多。大衛召見基甸人，問他們說：“我當為你們做什麼，才可贖這罪，使你們為耶和華的產業祝福呢？”基甸人回答說：“那從前謀害我們，要滅我們的人，現在願你將他的子孫七人交給我們。”大衛說：“我必交給你們。”
大衛因為曾與約拿單起誓結盟，就愛惜約拿單的兒子米非波設，沒有把他交出來。他把愛雅的女兒利斯巴給掃羅所生的兩個兒子，以及掃羅女兒米拉所生的五個兒子，交給了基甸人。基甸人就把他們懸掛在山上，他們被殺死的時候正是動手割大麥的日子。愛雅的女兒利斯巴用麻布在磐石上搭了一個棚，從動手割麥的時候，直到天降雨在屍身上的時候，她就一直在看護著屍身，日間不容空中的鳥雀落在屍身上，夜間不讓田野的走獸前來糟踐。
有人將此事告訴大衛，大衛就去基列雅比，將掃羅和他兒子約拿單的骸骨搬了來。當年非利士人在基利波殺掃羅及其眾子，將屍身懸掛於伯珊的城牆上，是基列雅比人把屍身偷回來埋葬。大衛將掃羅和約拿單的骸骨從那裏搬來，又收斂了被懸掛的七人的骸骨，都葬在便雅憫的洗拉掃羅父親的墳墓裏。
另一次災變則來自耶和華的憤怒。原來以色列在大衛的統治下開始繁榮起來，人口也增多了。以色列人卻不知敬畏耶和華，耶和華向以色列人發怒，就激發大衛，使他吩咐人去核查以色列和猶太的人口。清點的結果是，以色列有80萬，猶太有50萬人。
耶和華派遣先知迦得去見大衛說：“耶和華如是說：我有三樣災，隨你選擇哪一樣，你願意國中有7年的饑荒嗎？還是願意被你的敵人追趕3個月？還是在你的國中有3日的瘟疫？”大衛對迦得說：“我甚為難。我願落在耶和華的手裏，因為他有豐盛的憐憫，我不落在人的手裏。”
於是耶和華降瘟疫與以色列人，自早晨到所定的時候，從但直到別是巴，民間死了7萬人。天使向耶路撒冷伸手要滅城的時候，耶和華後悔了，就命天使說：“夠了，住手吧！”那時耶和華的使者在耶布斯人亞勞拿的禾場裏。大衛看見災民的天使，就禱告耶和華說：“我犯了罪，行了惡，但這群羊做了什麼呢？願你的手攻擊我和我父親家。”
當日迦得來見大衛，要他到耶布斯人亞勞拿的禾場上，為耶和華築一座壇。大衛到了那裏，亞勞拿連忙迎上前來。大衛說明了來意，亞勞拿說：“我主我王，這裏有牛可作燔祭，你愛用什麼，都拿去獻祭。”大衛說：“不然，我要按著價值向你買，我不肯用白得之物作燔祭，獻給耶和華我的上帝。”大衛用5 0舍客勒銀子，買了那禾場與牛，在那裏為耶和華築了一座壇，獻上燔祭和平安祭。如此，耶和華聽國民所求的，瘟疫在以色列人中就止住了。