當時天地初成，天地間有無數劫變，元始天王把太元聖母召到他的玉京山上，後每經一劫，就與她歡愛一次，這樣經過了很久很久之後，太元聖母生出了第二個兒子，由於這時她體內還是餘氣未清，生出來的骨肉是半獸半人：一個有著13個頭的兒子，他就是後來東王公，號稱元陽父！後來又生了一個女兒九光元女，號稱太真西王母，也就是現在的王母娘娘，她亦是半人半獸，有著虎齒，豹尾，易嘯，常披發，直到後來得太上老君之助才脫胎換骨，母儀天上！至太元聖母生出第九子玉清真王後，元始天王因為壽數已到，軀體與元神都麵臨死亡，於是他化作青氣，雜在天地精氣之中躍入太元聖母身體之中，借法轉世重生，太元聖母懷了他十二年後，從胳肢窩裏生出了元始天王再世托生的小嬰。太元聖母在十二重天中建了一宮，命名為玉清宮，紫雲成閣，碧霞為城給他住，做完這一切，太元聖母也因為元氣耗盡，沒多久就化作了煙塵，與天地重歸於一體，而這個小嬰後來被稱做元始天尊！
東王公住在東海方諸山上的紫府裏，治理天地陰陽兩氣，至玉皇大帝時代時，諸神基本上都是元始天尊等三清的門徒或友人，東王公也成為三界十方四生六道中男子登仙得道者的入門管理員，負責起登錄仙籍與成仙後入門理論功課的指導者，被譽為仙上之仙，人間則多稱他為東華帝君。西王母則居然在昆侖山上，過起了一陣子無憂無慮的神仙生活。
元始天尊出生的時候，宇宙還是很不穩定，除了厲害如鳳凰麒麟這樣的神禽異獸，尋常生物無法長期生存下來，後來道教把這個時期稱為洪元世紀，到了被道教稱為混元世紀的時候，又一位孕育已久的神仙誕生了，他就是靈寶天尊，又稱為太上道君。混元世紀結束後的太初世紀才是天地開始熱鬧起來的時代。