而事實上，作為軍隊一方被推出來主持25日以後成立的聯合行動委員會（反罷課委員會）之人，乃是中央軍第五軍軍長邱清泉，並不是他警備總司令關麟征，直接調派軍官總隊學員參與“一二·一”暴力行動的同樣也不是他關某人。當血案發生，事情鬧大之後，關麟征最記恨的不是邱清泉而是李宗黃。邱清泉外號“邱瘋子”，其性格比關麟征還暴戾不馴，且為人處世總是瘋瘋癲癲令人感覺不踏實。[10]關認為邱作為一位比自己還要直來直去的武人，同樣是上了李宗黃這位老黨棍的大當，懵懵懂懂鑽進了李的褲襠，不知不覺成了他支使的“老二”。
於是，在即將需要有人出麵承擔指使殺人責任時，關麟征自然地站在了邱清泉一邊，並竭力設法替邱與所有參與此事件的軍人辯白與解脫，因為隻有軍人得以解脫，他才有解脫的可能，可謂一損俱損，一榮俱榮。此後他在向重慶拍發的密電和對外公開談話中，一再強調李宗黃與其手下的三青團、特工分子才是導致這次血案真正的罪魁禍首，並明言所有情報都來自於李手下的特工部門，而這些人又不在他的管轄之下，因此對於這類事情他“控製不了局勢”，隻能坐觀其愈演愈烈而無力加以阻止。端坐省黨部椅子上惶惶不安的李宗黃，忽見昔日的盟友關麟征欲金蟬脫殼，反戈一擊，把所有的罪過一股腦地安到他的頭上，想置自己於死地，立時大怒，驅車奔向警備司令部要與關氏理論個明白。
在警備司令部會客廳，李宗黃倚老賣老，以保定軍校的老資格，欲教訓這位後進的黃埔一期生（南按：黃埔的許多首長和教官都來自於保定軍校。從廣義上講，保定與黃埔兩校有著師承關係）。想不到此時的關麟征已顧不得輩分落差，家長裏短了。且目前是文武兩官，各管一邊，大家都是爺，誰也別把誰當孫子看待。見李宗黃主動找上門來又吵又鬧，關麟征怒發衝冠，驀地從腰間拔出手槍，“咣當”一聲拍在桌子上，蹦著高兒對李宗黃咆哮道：“我不想當屠夫，這屠夫就留給你去當吧！”
李宗黃一看小關在自己這位革命老前輩麵前耍起了威風，遂以“永遠不為惡勢力低頭的革命精神”衝上前來，喊了一聲：“媽拉個巴子的小關，你想造反不成？！”照準對方那圓滾肥胖得如同西瓜一樣的腦袋（南按：關氏身高體壯，江湖上人送外號關胖子，或關老爺）就是一記響亮的耳光。戎裝在身，氣勢如虹，在年齡上正如狼似虎的關麟征，一看這個老渾蛋竟敢跑到自己的一畝三分地裏撒野耍潑，簡直是太歲頭上動土，佛頭抹糞，灶王廟裏撒尿，頭上的火苗“哧”地躥將上來。憤怒至極的關總司令顧不得多想，猛地後撤一步，做虎步塌腰狀，用盡力氣照準李宗黃的小腹部就是一個下勾拳。隨著“噗”的一聲悶響，本來就瘦弱不堪、年近六十的李氏應聲倒地，四爪朝天，蹬歪不止。關胖子見狀餘恨未消，趁勢上前又照李的臀部猛踹兩腳，直踹得李宗黃嗷嗷叫著大呼“救命”。眾位軍官衛士圍將上來，連拉帶扯，總算把盛怒中的關麟征拉到了一邊停止攻擊。
李、關雙方互毆後，為了替自己辯白，關麟征派人把聯大兩位英籍教授找來，專門向其解釋事件經過，希望兩位教授能站在局外人立場上，理性公正地分析、看待這次事件的是非曲直，並把真實情況轉告國際社會。關一再聲明：25日夜晚放槍不是他的指使，自己更不是12月1日慘案的策劃人。最後大罵李宗黃不懷好意地設計圈套害了自己，並怒氣衝衝地說：“無論出了什麼事他們都會把罪名加給我。”[11]
就在雲南軍政當局內部陷入混亂時，12月3日上午，蔣介石向侍從室的唐縱詢問昆明學潮情況，聞後大怒，當即表示“對投彈凶手，飭即電令槍斃”[12]。唐馬上用電話向關麟征與省主席盧漢傳達了蔣的意旨。下午四時，蔣再次詢問昆明局勢，表示自己的焦慮與關切，謂：“此次學潮與過去不同，有血案，必須追查殺人凶手以平息民憤和國內外輿論，否則學生的罷課不會停止。”