12月20日，船隊在四周環山的阿庫爾灣下錨。友好的當地居民將一些黃金飾物獻給了他們。一件嵌金的精繡棉布被作為禮物送給了哥倫布，這是在東邊幾英裏外的一個部落酋長特意送來的，得到禮物的哥倫布決定馬上回訪。然而在途中，“聖瑪麗號”不幸觸礁，所幸並無大礙。
哥倫布從這位酋長那裏得知在內地有一個黃金十分豐富的叫錫瓦奧的地方。這一次，錫瓦奧又被哥倫布誤解為可能是日本國的誤讀，因此他更認為無盡的寶藏終於要被發現了，從而也更相信這個西班牙島就是位於中國東邊海上的日本國。這個想法讓哥倫布感到踏實和安慰了許多。他們在岸上修了一個寨堡，木料來自於“聖瑪麗亞號”船的殘骸，命名為納維達德，西班牙語的意思就是“聖誕節”。作為在這新大陸上的第一次殖民活動，哥倫布留下40人開采伊斯帕尼奧拉的金礦。隨後，他們帶著從島上弄到的各種特產，大量的黃金以及那六個印第安人作為這次發現的證物，於1493年1月4日起錨開始了返回西班牙的漫長航程。
兩天後，哥倫布的“尼娜號”又和正貼岸向西航行的“平塔號”重新會合。兩隻探險船無畏地駛向茫茫大西洋。兩星期後，伊斯帕尼奧拉的群山就再也看不到了。歸航的旅途也是驚險萬狀的，同樣經曆了驚濤駭浪和狂猛的風暴，在亞速爾群島附近，兩艘船又被巨大的風浪所衝散。
終於，曆盡坎坷的“尼娜號”到達了出發地裏斯本，駛進了出發時的帕洛斯港。平塔號在幾個小時後也進了港口。經過了7個月零12天，這些疲倦的探險者終於又回來了。
哥倫布一生中最愉悅的日子要算他回來後的幾個月，4月中旬他被召進宮，並且得到了將軍的封號，隆重的招待也大出哥倫布意料之外。哥倫布也因此成了風雲一時的英雄。
此後哥倫布三次重複他的向西航行，又登上了美洲的許多海岸。然而當哥倫布結束曆時兩年半的最後航行時，雖身患重病，情緒憂鬱，得到的卻是國王的一道命令：變賣哥倫布全部動產，查封其他財產，以便清算他的債務。
哥倫布發現的巨大意義，是在征服、占領墨西哥、秘魯和北安第斯山脈的國家之後，成堆的黃金和的白銀進入歐洲時才為16世紀的西班牙人所明白，並得到他們的公認。而哥倫布探險所具有的世界曆史意義和革命意義隻是到了19世紀的中期才由《共產黨宣言》的作者們給予首次肯定。
哥倫布的發現成為新大陸開發和殖民的新紀元，是曆史上一個重大的轉折點。15世紀歐洲人口急劇膨脹，新大陸的發現，是歐洲人有了可以移民的場所，也有了可以使歐洲經濟發生改觀的礦石和原材料。新航路地開辟，進一步推動了世界各地之間的文化交流。美洲的橡膠、玉米、煙葉、番薯、可可與馬鈴薯等物產都是通過西班牙人帶回歐洲後傳遍世界各地的。而歐洲移民也將把大麥、黑麥、燕麥、水稻等植物以及馬、牛、騾等牲畜帶入美洲並在那裏生根發芽，世代繁衍。這大大豐富了東西半球的文明交流。另一方麵，從長遠來看，此發現還致使西半球出現了一些與曾在該地區定居的各個印第安部落截然不同的新國家（美國），對舊大陸的各個國家帶來極大的影響。但同時，這一發現卻導致了美洲印第安人文明的毀滅。可以說，哥倫布發現新大陸具有非正義基礎上的客觀進步性。
遺憾的是，直到1506年逝世，哥倫布都一直認為他到達的是印度。後來，一個叫做亞美利哥的意大利學者，經過更多的考察，才知道哥倫布到達的這些地方不是印度，而是一個原來不為人知的新的大陸。哥倫布發現了新大陸，但是，這塊大陸卻用證實它是新大陸的人的名字命了名：亞美利加洲。