多爾袞打敗李自成後，命令清軍每天奔行120多裏，一路上幾乎沒遇什麼阻擋，便於五月二日到了北京城。這天，多爾袞乘輦由朝陽門入城，明朝的文武官員迎出5裏地以外。多爾袞在武英殿升座，接受了眾官的拜賀，宣布定北京為都城。隨後，他派兵先後奪取了河北、山東、山西等省，大大穩定了北京地區的社會秩序。多爾袞采納降臣洪承疇、範文程的建議，下安民告示，為明帝後發喪，給予隆重葬禮，免除明一切苛捐雜稅以及擾民不便民諸事，重用降臣，不加派田賦。這一些措施，很快穩定了局勢。這一年九月，皇太後和福臨在濟爾哈朗護送下，從沈陽出發，前來北京。
順治元年九月九日，濟爾哈朗統率一支騎兵部隊，簇擁著一輛黃蓋車，像一股滾滾洪流駛進山海關，向北京方向湧去。黃蓋車中坐著神采奕奕的布木布泰太後。她的身旁，是清世祖愛新覺羅·福臨。他們不時透過簾布的縫隙，眺望車外的壯麗山河，驚歎不已。九月十六日，福臨車駕到達通州（今北京通縣），多爾袞率諸王、貝勒、文武群臣前往行殿朝拜。十九日，福臨從正陽門進入皇宮。二十五日，多爾袞諸王及滿漢官員上表，勸福臨即皇帝位。十月初一日，福臨前往南郊，祭告天地，並派遣官員祭告了太廟和社稷，正式即皇帝位，成為清王朝入主中原、君臨全國的第一代皇帝。從此，中國曆史進入清朝統治時期。
7歲的福臨沒有能力處理朝政，國家大權實際上掌握在多爾袞手中。早在崇德八年十二月，多爾袞就宣布自己“身任國政”。他要求各部尚書、侍郎和都察院聽命於他，否則決不寬恕。他規定各衙門辦理事務，凡是向皇帝上奏或要記入檔案的，一律先啟知於他。這樣，多爾袞便獨掌了朝政，稱“攝政王”。輔政大臣之一的濟爾哈朗也隻好退居第二。為了尊崇多爾袞的地位，順治元年一月，初步議定了攝政王的各種禮儀，規定其他各王不得平起平坐。多爾袞實際上享有了皇帝的尊榮和權力。他掌理國政，權高望重，天下隻知有攝政王，不知有順治帝。他如果要廢順治自立，易如反掌。他沒有這樣做，其中也許是受了布木布泰太後的影響。
多爾袞以攝政王之尊，出入內宮，和太後接觸頻繁。時太後年方31歲，正值盛年，一種成熟的美麗更惹人愛慕。多爾袞比太後大兩歲，常常為太後之美所吸引，而太後也頗欣賞這位年輕的小叔子。另一方麵，為了維護兒子順治帝的地位，她對多爾袞也特別禮敬、殷勤，日久情生，難舍難分。太後為了籠絡和控製多爾袞，鞏固自己和福臨的地位，便按照滿族父死則妻其後母、兄死則妻其嫂的習俗，下嫁給多爾袞。但在太後下嫁之前，必須先去掉攝政王妃——太後的親妹妹。攝政王妃在這種情形下，一夕暴崩，成了這件事的犧牲品。
公元1646年，即順治三年，經過多爾袞與範文程密計，範文程在上朝時說：“攝政王功高望重，謙抑自持。我皇上雖想報答，將什麼來報答呢。雖然王是皇上的叔父，今日之事，猶如父傳其子。王既然以子視皇上，則皇上也應當以父視王。怎麼樣？”眾人議說可以。範文程接著說道：“今聽說王失去王妃，而我皇太後又寡居無偶。皇上既然視王像父親一樣，今不可使父母異居，宜請王與皇太後同宮。”眾又說可以。於是，群臣上賀表。當時，以順治帝的名義頒發了一篇皇帝的文告，宣示天下：
“太後盛年寡居，春花秋月，悄然不怡。朕貴為天子，以天下養，乃獨能養口體，而不能養誌。使聖母以喪偶之故，日在愁煩抑鬱之中，其何以教天下之孝！皇叔攝政王，現方鰥居，其身份容貌，皆為中國第一人，太後頗願紆尊下嫁。朕仰體慈懷，敬謹遵行。一應典禮，著所司預辦。”
時人張煌言曾寫過一首宮詞：“上壽稱為合巹樽，慈寧宮裏爛盈門。春宮昨進新儀注，大禮恭逢太後婚。”形象地描述了他們的婚事。到乾隆朝，史家紀昀在修史時看到這件事，認為這是件醜事，便請示高宗毀掉了這段記載。其實，太後下嫁也不是什麼了不起的事。既然允許姑侄同侍一人，當然也會出現叔嫂結合了。清軍入關後，漢族的封建文化對滿族的影響日益深入，其中也包括傳統的封建禮教。太後與攝政王多爾袞結婚，當時曾受到維護封建禮教的漢大臣的指責和反對。但皇太後斷然下嫁，藐視封建禮教，是很有勇氣的。
公元1649年，即順治六年一月，多爾袞改稱“皇父攝政王”，並通行於全國。
正當多爾袞誌滿意得的時候，順治七年十二月初九日，他突然咯血，病死在塞外的喀喇城，時年39歲。多爾袞死後，順治追尊多爾袞為“誠敬義皇帝”，並以“帝製禮”落葬。