和官軍手足無措形成強烈對比的是，白蓮教眾在張獻忠的親自督戰下，作戰十分勇敢，衝鋒異常勇猛，很快的，他們就在杞縣城頭站穩了腳跟。
杞縣的城防被打開一個突破口，這對雙方的士氣造成了不小的影響，每一個守城的士兵都清楚，一旦自己的城垛口裏出現了敵人的麵孔，那也意味著城池的失守，敵人能上來一個，就能上來兩個，三個，無數個……；而攻城的也明白，隻要他們中的一個在城頭站住了腳，他們就能一個接一個的衝上去，而整座城池也將成為他們的戰利品。
在白蓮教眾震天的喊殺聲中，看著白蓮教眾在城頭越來越多，李牟覺得沒有什麼作為了，杞縣失守已經不可避免，下一個主要問題是他如何逃生。
李牟率領殘兵從東麵潰退，白蓮教眾隨後殺到，在這次戰鬥中，白蓮教眾一共殺了一千多官軍，杞縣的負責人李牟身受重傷，僅僅帶著十幾個騎兵逃出生天。
很久以來，不管是在陝西還是在山西，張獻忠最打怵的活計就是攻城，因為他們每攻下一個城池都會付出很大的代價，雖然城破後可以搶劫，裹挾青壯，但是在士氣和戰鬥力方麵，都大受影響，張獻忠的心理上形成了對攻城的畏懼感。
杞縣城下，張獻忠看著自己的人馬開進城內，這次的攻城是他所有戰績中感到最爽快的一次，給他二次複出添加了一個好彩頭，也使日漸低下的士氣恢複不少。
張獻忠這幾年沒白跟著徐弘祖混，在各個方麵都有了長足的進步，拿今天來說，他拿下城池後，馬上叫人寫了安民告示，並嚴肅的告誡手下不要為非作歹，使杞縣的治安沒受多大影響，同時派人打聽杞縣的鄉紳富戶，隻要家財總資產超過二百兩銀子的，都列出名冊，然後按照名冊前去抓人。
張獻忠不管你是有錢的善人還是為富不仁，隻要有點家產的人都被他抓到了杞縣縣衙的院內，先是好生詢問每個人的家產狀況，對於不合作的則嚴刑拷打，然後按照這些人的交代前去“抄家”。不把這些人的家財搜刮一空，絕不放手。
張獻忠將搜刮來的銀子糧食等硬通貨拿出很大一部分分發給杞縣的窮苦老百姓，對於從天而降的大餡餅，沒有人會拒絕，一時間整個杞縣都沸騰了。
盡管張獻忠拿出了大頭，但是剩下的收獲對於他和手下的一萬多人來說也不是小數目。有些白蓮教徒從來沒見過手中的小金塊，用牙咬了咬，又在衣服上蹭了蹭，才小心翼翼的貼身藏好，他們心中對張獻忠的做法很滿意，因為再來這麼幾次，他們也成一個小財主了。