２７６９年，由於不堪忍受技術及稅務剝削，哈魯殖民星係驅逐了太陽係聯盟的代表，叛亂發生。三年內太陽係聯盟的兩隻艦隊先後被反叛軍全殲，諸殖民星係開始觀望，次年太陽係聯盟再次組織了十倍的軍力進行第三次戰爭，哈魯星叛亂被平定，但這一代價慘重的反叛為日益龐大的太陽係聯盟敲響了警鍾，各殖民地在之後頒布的《殖民地自治法案》中獲得了較獨立的政治地位，剝削程度有所減輕。各大財團在戰爭中獲取巨利，日漸強大。２７７３年戰爭結束時，“官方公布”的戰爭死亡人數九萬三千人，哈魯殖民星係軍民七萬零三百二十人，聯盟宇宙軍官兵兩萬兩千人，餘為各星係被戰爭波及人口。但經濟損失數量驚人，商業貿易出現百年不遇的低潮、聯盟政府戰爭赤字超過三百萬億聯盟元。
２８８０年，人口調查顯示，聯盟人口已超過一千二百億，人類的觸手伸向了第四旋臂，邊界膨脹性的向銀河深處擴展。
兩大文明之間在日漸頻繁的交往中爭端驟起，摩擦日漸頻繁，諾亞利昂帝國貴族的傲慢，聯盟不法商人的詐騙行徑，海盜行為的增加，聯盟的貿易傾銷，以及諾亞利昂人對地球文明的恐懼，當時聯盟總人口已經突破兩千億，而諾亞利昂人及其附庸，不過三百七十億左右，經濟總量對比為１：１.３。在２９２５年７月１４日的一次諾亞利昂軍艦對地球商船的檢查中，發生了暴力衝突，諾亞利昂軍艦被地球商人劫持，其後逃回了聯盟轄區，帝國的年輕貴族組成的“克裏斯軍官團”對聯盟的遲鈍反應極為不滿，私自率領第三邊防艦隊發動了橫跨宇宙的軍事突襲，戰爭爆發。十年內，帝國的軍隊縱橫銀河，當者無不分崩離析，無人可敵。隨著人類全體的努力，以極低的薪水加班加點的工作，戰爭潛力被迅速開發出來。裝備各種新技術的軍艦開始成批的服役。由於對敵海盜行為的合法化，帝國的補給線路被海盜和遊擊艦隊攪得一團糟。聯盟的戰略縱深讓帝國軍隊吃盡了苦頭，逐個防禦的星係耗盡了帝國的鮮血，長期離鄉帝國士兵厭戰情緒加倍增長。
戰爭到了關鍵性的第二十一年，諾亞利昂艦隊第二次進攻地球，聯盟宇宙軍，展浩翔艦隊終於取得了第一個勝利。聯盟的反攻如催枯拉朽般開始。三年後即攻入了諾亞利昂帝國境內。聯盟軍遭遇了更頑強的抵抗，殘酷無比的戰爭讓兩大文明大量失血。
２９５２年，最後一隻諾亞利昂帝國的艦隊在銀心柱石座星域被聯盟軍元帥喬?凱因斯所率領的艦隊擊潰。諾亞利昂帝國的強硬分子駕駛飛船逃往銀河的另一端。其附庸的數個文明和大部平民在年輕皇子“乍爾?梅?克拉盧斯”及帝國下議院的率領下宣布無條件投降。同年，太陽係聯盟更名為銀河係聯盟。在這場可怕的戰爭中，聯盟軍民死傷超過五百億，幾乎每家皆有一名死者，諾亞利昂人死傷超過一百五十億，人類的文明地球也遭受重創，數百個居人星球和無數的殖民地被夷為平地，經濟損失達九萬萬萬億聯盟元。而各大財團卻在戰爭中獲取了難以想象的利潤，成為聯盟內更加重要的存在。詩人海斯如此的形容他們“這些偷走了聯盟骨頭的惡犬。”作為戰敗懲罰，投降的諾亞利昂人賠償了兩百一十五個類地行星給聯盟，並被限製在第二旋臂一角的三十二個星團內，無通行證不得離開，人口數量亦不得超過兩百億，戰爭賠款十五萬萬萬億元分期二十萬年支付。諾亞利昂諸星團最終成為了聯盟商品最重要的傾銷市場之一。
２９５２―２９７７十五年間為戰後的生育高峰期。２９９０年，聯盟人口數量贈至一千八百億，之後人口數量的增長逐步縮減。
由於聯盟經濟連續五年衰退，３０５０年１月１日，《惑星開發法案》頒布實施，半強製性的加強了宇宙開發的力度。第三次生育高峰及人種大融合開始。人均壽命平均大於三百年，人類曆史上每十年，人均壽命就增加兩歲，每一百年會飛躍十至三十年，每一千年會產生一個難以估算的飛躍，至今約有千分之一２４００年以前出生的人類、百分之三２５００年以前出生的人類及十分之一２６００年以前出生的人類一直活著，由於聯盟疆土的寬廣，具體數字難以統計。