九月
9月初
小湯山現代農業科技示範園被國家科技部、農業部批準為國家級科技園區。
21—22日
市科委召開2001年度北京市科技外事工作會議。市科委範伯元主任以《加強國際合作，促進首都國際化科技創新城市建設》為題作了科技外事工作報告。林文漪副市長到會並講話。市各委辦局、總公司、區（縣）、大學、研究院所、技術開發區等單位科教外事工作負責人約160餘人參加會議。會上，還隆重舉行了國際科技合作協會獎頒獎儀式，對推進北京市國際合作工作有突出貢獻的獲獎者頒發了榮譽證書和獎金。
25日
占地約70畝的生物芯片北京國家工程研究中心建設項目在中關村生命科學園正式啟動，成為中關村生命科學園第一家正式啟動建設的研究中心。生物芯片北京國家工程研究中心是北京市60項重大建設項目之一，已納入北京市“十五”規劃。此舉不僅標誌著作為國家重大技術工程的生物芯片已經進入實施階段，也標誌著我國生物“芯”的培育初見成效。
十月
10日
市科委召開新聞發布會，公布2001年北京市科技進步獎評審結果。2001年共受理本市各區、縣、局、總公司，高等院校、科研院所及中央和軍隊在京有關單位等200餘個推薦部門的585項推薦項目。經過專家們認真嚴格的三級評審（初評、複評、終評），已評選出2001年度市科技獎勵項目330項，其中一等獎16項，二等獎119項，三等獎195項。
12—17日
第三屆“中國國際高新技術成果交易會”在深圳舉行，北京派出100餘人的代表團參展，副市長林文漪任團長。北京展團確定了高新技術、中關村科技園區和科技奧運等三大主題，共有30餘家高新技術企業和科研機構加盟，攜帶項目近百項。北京展團共有19個項目簽約，交易總額達到9.7億元，超過上屆的8.3億元，被高交會組委會評為“優秀組織獎”和“優秀成交獎”。
18日
北京市科學技術研究院與北京工業大學舉行產學研合作簽字儀式。雙方合作的主要目的是通過產學研的合作方式，使北京工業大學的教學與科研優勢和研究院的科技開發、科技谘詢以及科普工作的特色優勢相結合，力爭在電子信息、生物與新醫藥、環境與安全、新能源與節能技術等首都經濟重點發展領域中做出更大的貢獻。
23日
北京市機構編製委員會辦公室發文（京編辦［2001］133號），同意成立北京生命科學研究所。北京生命科學研究所為實行企業化管理的事業單位，主要承擔生命科學前沿領域的基礎研究以及人類健康、醫學保健、農業發展、生態保護密切相關的基礎應用研究。
26日
六所學園軟件產業孵化器有限責任公司正式成立。該孵化器是北京第二個軟件產業專業孵化器，以信息產業部電子第六研究所（華北計算機係統工程研究所）為依托。
10月底
為了貫徹全國農業科技大會精神，推動《農業科技發展綱要》的落實，加強農業科技成果轉化資金管理，促進農業科技成果盡快轉變為現實生產力，科技部和財政部共同製定了《農業科技成果轉化資金項目管理暫行辦法》，並授權科技部中小企業技術創新基金管理中心組織項目申報。按照國家科技部要求，北京市科委組織北京市農業科研單位和有關農業公司共申報“農業科技成果轉化項目”134項。經專家評審，選出122項上報國家科技部。
十一月
9日
北京市政府發文頒布《北京市關於進一步促進高新技術產業發展的若幹規定》。
15日
市科委、統計局、教委、計委、經貿委、財政局、工商局、科工辦八單位聯合發布了2000年“北京市全社會R&D資源清查”主要數據結果。實施“北京市全社會R&D資源清查”工作，是根據科技部、國家統計局、財政部、國家計委、國家經貿委、教育部、國防科工委七部委的聯合部署，自2000年9月開始進行的，已基本完成調查階段的任務。國家七部委已於10月11日發布了2000年全國R&D資源清查主要結果。
22日
北京機床研究所與中國長城資產管理公司、中國華融資產管理公司簽訂了實施債轉股的協議，實施債權轉股權的總金額為2.17億元。該所是我國機床行業中規模最大，實力較強，機、電、光、氣、液等專業技術同步發展的綜合性技術研究所，1999年7月由中央直屬科研事業單位轉製為科技型企業，隸屬於北京市管理。
26日
荷蘭副首相尤裏茨瑪女士與國家科技部徐冠華部長在北京簽署了中荷兩國關於車用LPG（液化石油氣）科技合作項目的正式結束文件，林文漪副市長出席了簽字儀式。根據1999年6月兩國簽署的協議，荷蘭政府向北京市贈送了80套用於電噴型出租汽車的LPG改裝件、10套用於公共汽車的LPG改裝件和3座LPG加氣站的主要設備。在曆時兩年的項目實施過程中，先後完成了國產捷達、桑塔納、富康、夏利4種樣車在荷蘭的研發與測試，以及利用荷方所贈設備在北京市對出租車與公共汽車進行改裝、檢測試驗等工作，3座LPG科技示範加氣站也陸續建成開業。
十二月
12月初
北京英納超導技術有限公司建立的我國第一條鉍係高溫超導線材生產線正式投入生產，成功生產出數根具有世界先進水平的千米級高溫超導線材，實現了我國高溫超導線材產業化的重大突破，使我國成為世界上為數不多具有高溫超導線材生產技術及產業化生產能力的國家之一。
13日
首科花園奠基儀式舉行，市領導張建民、林文漪出席活動。首科花園坐落在北京西站南端，占地10多公頃，建成後可居住2000餘戶，計劃2002年底首期竣工。首科花園是繼首都高校育新花園、望京花園教工住宅之後，北京市第一次專門為科技人員建設的住宅區，科技人員將享受到經濟適用房的政策。
17—18日
國家科技部召開專題驗收會，對清潔汽車行動的重要組成部分、“九五”科技攻關項目——清潔汽車行動試點示範工程（全國首批12個）進行驗收。專家組認為北京市燃氣汽車推廣工作近年來取得顯著進展，適應燃氣汽車快速、健康發展的政策法規和管理體係軟環境基本建立。在單一燃料CNG公交車的推廣使用方麵，積累了重要的運營管理等方麵經驗，為今後單一燃料燃氣汽車的大規模推廣使用打下了基礎。
26日
北京天文館新館破土動工。北京天文館新館建設被列入今年擬辦的60件實事，總投資2.4億元人民幣，建築麵積2萬多平方米，2003年竣工。北京天文館新館在建築風格上與老館相互輝映，新館大樓建有圓頂大眾天文台、數字宇宙劇場和3D動感劇場等新式設備、展廳，將為北京增添豐富多彩的科普內容。